BMN-Farbstoffe und Quencher
BMN-Farbstoffe – Farbstoffe von biomers.net
BMN-488, BMN-505, BMN-536, BMN-562
Zusätzlich zu der breiten Auswahl an bekannten Fluoreszenzfarbstoffen bietet biomers.net auch eigene hervorragende Alternativen an. Die sogenannten BMN-Farbstoffe können am 5´- oder 3´-Ende an ein Oligonucleotid angebracht werden.
| Farbstoff | ABS [nm] | EM [nm] | Alternative zu |
|---|---|---|---|
| BMN-488 | 495 | 519 | Atto 488, Alexa Fluor 488® (identische Struktur) |
| BMN-505 | 507 | 524 | Fam, Fluorescein, FITC |
| BMN-536 | 536 | 553 | Carboxyrhodamin 6G, Atto Rho6G |
| BMN-562 | 562 | 578 | Rhodamin B |
| BMN-5 * | 645 | 671 | Cyanine 5 |
| BMN-6 * | 681 | 704 | Cyanine 5.5 |
* Aufgrund der geänderten Patentsituation der Cyanine, empfehlen wir die Verwendung der analogen Cyanine-Farbstoffe Cyanine 5 (analog BMN-5) und Cyanine 5.5 (analog BMN-6).
BMN-Quencher – Quencher von biomers.net
BMN-Q460, BMN-Q535, BMN-Q1, BMN-Q2, BMN-Q620
Neben der breiten Auswahl verfügbarer Quencher, bietet biomers.net auch ein "eigenes" Set an Quenchern an.
Die BMN-Quencher von biomers.net sind aufgrund ihres optimal passenden Quenchbereichs hervorragende Alternativen zu den herkömmlichen Dark Quenchern.
| Quencher | ABS [nm] | Quenching Range [nm] | Alternative zu |
|---|---|---|---|
| BMN-Q460 | 453 | 400-530 | Dabcyl, DDQ I |
| BMN-Q535 | 535 | 480-580 | BHQ-1, TQ2, DDQ I, Iowa Black FQ, Eclipse-Quencher, Dabcyl |
| BMN-Q1 | 535 | 480-580 | BHQ-1, TQ2, DDQ I, Iowa Black FQ, Eclipse-Quencher, Dabcyl |
| BMN-Q2 | 580 | 500-650 | BHQ-2, TQ3 |
| BMN-Q590 | 590 | 550-650 | will be discontinued |
| BMN-Q620 | 620 | 480-720 | BHQ-2, TQ3, BBQ-650, DDQ II, Iowa Black RQ |
| BMN-Q651 | 650 | 550-720 | BBQ-650, DDQ II |
Abbildung 1: dT20-Oligo mit 3´-Quencher, Messung der Absorptionsspektren in Pufferlösung (pH 7.0)
BMN-Q460
Mit einem Absorptionsmaximum von 460 nm eignet sich unser Dark Quencher BMN-Q460 besonders für den kurzwelligen Bereich und stellt eine hervorragende Alternative für die Quencher Dabcyl und
DDQ I dar.
Neben dem Einsatz in Molecular Beacons, bei denen er durch direkten Kontakt Fluoreszenzsignale inhibiert, findet BMN-Q460 in den verschiedensten molekularbiologischen Bereichen Anwendung. Als 3´-Quencher in Dual-Labelled Probes (5´-Nuclease Assay) kann er insbesondere im Bereich von 400-530 nm verwendet werden, sodass er sich bestens für die Fluorophore Atto 390, Atto 425 und Atto 465 eignet.
biomers.net bietet den Quencher BMN-Q460 als 5´-, 3´- oder interne Modifikation an.
BMN-Q535
BMN-Q535 ist der zweite Dark Quencher der Firma biomers.net mit einem Absorptionsmaximum bei ca. 535 nm und einem Quenchbereich von etwa 480 nm bis 580 nm. Damit liegt BMN-Q535 im gleichen Bereich wie BHQ-1, TQ2, DDQ I, Iowa Black FQ oder Eclipse-Quencher und kann als hervorragende Alternative zu diesen Quenchern eingesetzt werden.
Wir bieten Ihnen diesen Quencher als 5´- oder 3´-Modifikation an. Zusätzlich kann BMN-Q535 als interne Modifikation in Double Quenched Probes mit erhöhter Sensitivität eingesetzt werden.
| Dual-Labelled Probe | Double Quenched Probe | Molecular Beacon Probe |
|---|---|---|
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BMN-Q1 und BMN-Q2
BMN-Q1 und BMN-Q2 sind die eigenschaftsgleichen Alternativen zu BHQ-1 und BHQ-2.
BMN-Q620
Ähnlich wie die Quencher BMN-Q460 und BMN-Q535 bietet biomers.net auch den Quencher BMN-Q620 als
5´-, 3´- und interne Modifikation an. Somit kann BMN-Q620 ideal in Double Quenched Probes für den längerwelligen Bereich eingesetzt werden. Mit einem Absorptionsmaximum von 620 nm und einem Quenchbereich von 480 nm bis 720 nm umfasst er einen relativ weiten Bereich und kann daher auch im längerwelligen Bereich Fluoreszenzfarb-
stoffe wie z.B. Cyanine 5 oder Cyanine 5.5 noch optimal quenchen.
BMN-Q651
Mit einem Absorptionsmaximum bei 650 nm und einem Quenchbereich von 550-720 nm deckt der biomers.net Quencher BMN-Q651 den längerwelligen Bereich optimal ab. BMN-Q651 kann als Alternative zu BBQ-650 oder
DDQ II eingesetzt werden.
