> Farbstoffe
SiR (5'-Modifikation)

Absorptionsmaximum [nm]
652
 
Emissionsmaximum [nm]
674
 
Der Fluoreszenzfarbstoff Silicium-Rhodamin (SiR), der strukturell mit den Rhodamin-Fluorophoren verwandt ist (z.B. Texas Red), ist ein relativ kleiner und heller Fluoreszenzfarbstoff aus dem dunkelroten Spektralbereich.

Im Gegensatz zu einer Vielzahl an Fluoreszenzfarbstoffen zur DNA-Markierung in Lebendzell-Aufnahmen, die eine Belichtung mit energiereichen blauen Licht voraussetzen, kann die langwellige Anregung den Effekt der Phototoxizität minimieren und ist aufgrund ihrer ausgezeichneten Photostabilität besonders für die hochauflösende Mikroskopie (z. B. STORM, STED) in lebenden Zellen geeignet. Aufgrund der langwelligen Anregung kann auch eine höhere Eindringtiefe und damit eine intensivere Bildgebung beobachtet werden.

Verglichen mit anderen Fluoreszenzfarbstoffen dieses Spektralbereichs weist der Farbstoff SiR in lebenden Zellen eine hohe Membranpermeabilität auf, sodass auf die Verwendung von fixierten Zellen oder die Zellpermeabilisierung, die mit einer Störung der Zellumgebung einhergeht, verzichtet werden kann.
SiR ist mit den meisten Mikroskopen kompatibel, da es mit den Standard-Cyanine 5-Filtereinstellungen verwendet werden kann.
SiR 5'-Modifikation: 5'-SiR Farbstoff
5'-SiR Farbstoff