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Oligonucleotide mit antiviralen Nucleosiden
 

Nucleosid-Analoga spielen als antiviral bzw. zytostatisch wirkende Substanzen eine wichtige Rolle. In diesem Zusammenhang sind auch Oligonucleotide mit entsprechenden Nucleosidbausteinen von Interesse, beispielsweise als Prodrugs.
Nachfolgende Abbildung zeigt eine Auswahl von modifizieten Nucleosiden, die in Oligonucleotide eingebaut werden können: 




1: 5-F-dU (5-Fluorouridine, Floxuridine), 2: 5-I-dU (5-Iodouridine, Iodoxuridine), 3: ß-L-dT (ß-L-2'-Deoxythymidine, Telbivudine ), 4 : Ara-A (Arabinoadenosine, Vidarabine), 5: Ara-C (Arabinocytidine, Cytarabine), 6 : dFdC (2',2'-Difluoro-2'-deoxycytidine, Gemcitabine), 7: ddC (2',3'-Dideoxycytidine, Zalcitabine ), 8: 3TC (Lamivudine) 

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5-F-dU, 5-I-dU, ß-L-dT, Ara-A, Ara-C, dFdC können sowohl am 3'-Ende als auch in der Sequenz eines Oligonucleotids eingebaut werden, auch mehrfache Kopplungen sind möglich. ddC und 3TC können aufgrund ihrer Struktur lediglich als 3'-Baustein dienen.
 



Literatur allgemein:

The evolution of nucleoside analogue antivirals: A review for chemists and non-chemists. Part 1: Early structural modifications to the nucleoside scaffold
Katherine L. Seley-Radtke and Mary K. Yates
Antiviral Res. 2018 Jun; 154: 66–86, doi: 10.1016/j.antiviral.2018.04.004

The evolution of antiviral nucleoside analogues: A review for chemists and non-chemists. Part II: Complex modifications to the nucleoside scaffold
Mary K. Yates and Katherine L. Seley-Radtke
. 2019 Feb; 162: 5–21, doi: 10.1016/j.antiviral.2018.11.016

Literatur zu Gemcitabine:

2',2'-Difluoro-deoxycytidine (gemcitabine) incorporation into RNA and DNA of tumour cell lines
Ruiz van Haperen VW, Veerman G, Vermorken JB, Peters GJ; Biochem Pharmacol. (1993); 46(4):762-6.

Quantification of gemcitabine incorporation into human DNA by LC/MS/MS as a surrogate measure for target engagement
Wickremsinhe ER, Lutzke BS, Jones BR, Schultz GA, Freeman AB, Pratt SE, Bones AM, Ackermann BL; Anal Chem. (2010); 82(15):6576-83. doi: 10.1021/ac100984h.

DNA Repair in Cancer Therapy: Molecular Targets and Clinical Applications
Kelley MR; Academic Press (2012), 95-98

Synthesis and restriction enzyme analysis of oligodeoxyribonucleotides containing the anti-cancer drug 2',2'-difluoro-2'-deoxycytidine
Richardson FC, Richardson KK, Kroin JS, Hertel LW; Nucleic Acids Res. (1992); 20(7): 1763–1768.